Le Conseil international des bois tropicaux est l'organe directeur de l'OIBT. Il comprend tous les membres de l'Organisation et se réunit deux fois par an pour développer des politiques relatives aux forêts et pour approuver et financer des projets à exécuter sur le terrain.

Le Conseil est aidé par quatre comités: le Comité de l'information économique et de l'information sur le marché, le Comité du reboisement et de la gestion forestière, le Comité de l'industrie forestière et le Comité financier et administratif. En général, ces comités se réunissent au cours des sessions du Conseil.