El órgano rector de la OIMT es el Consejo Internacional de las Maderas Tropicales, que comprende todos los miembros de la Organización y se reúne dos veces al año para formular normas y directrices relacionadas con la actividad forestal y aprobar y financiar proyectos para su ejecución en el terreno.

El Consejo recibe el apoyo de cuatro comités: el Comité de Información Económica e Información sobre el Mercado, el Comité de Repoblación y Ordenación Forestales, el Comité de Industrias Forestales y el Comité de Finanzas y Administración. Por lo general, estos comités se reúnen durante los períodos de sesiones del Consejo.